Metacore – Clarivate
Pour obtenir l’accès, veuillez demander votre login personnel de test en envoyant un courriel avec l’en-tête “New account trial MetaCore and KPA (CNRS) ”.
L’éditeur vous contactera directement.
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Suivez une présentation de Metacore en anglais :
« MetaCore est un logiciel d’analyse de données « omics » (génomique, protéomique, transcriptomique) et permet de mieux comprendre les mécanismes biologiques en lien avec ces données grâce à la curation et l’intégration par nos équipes de toutes les interactions validées scientifiquement par vos pairs. Cette plateforme contient plus de 1,5 million d’interactions moléculaires, plus de 1,500 pathway maps and 10 algorithmes de construction de réseaux d’interaction. La plateforme MetaCore a été évaluée par un groupe de chercheurs de la New York School of Medicine et a été classée première en termes de précision, fiabilité, et exhaustivité*. La curation manuelle est réalisée par des titulaires de PhD and MD avec une mise à jour trimestrielle. MetaCore est utilisé par les centres de recherche publics comme l’Université d’Harvard, les centres de recherche en biologie de Cambridge et Oxford, le Karolinska Institute ou encore Cancer Research UK.
Les principales fonctionnalités permettent de :
- Faire de l’enrichissement de pathways à partir de vos données grâce à la curation manuelle de notre équipe éditoriale ;
- Réaliser des comparaisons de données expérimentales (exemple Malade Vs control) pour mettre en évidence les différences en termes de mécanismes biologique;
- Faire de l’analyse de réseaux d’interaction (identification de régulateurs clés) ; »
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« Key Pathway Advisor est un module complémentaire de MetaCore qui permet aux chercheurs de comprendre les cascades de régulation qui expliquent les mécanismes moléculaires mis en évidence dans MetaCore. Les principales fonctionnalités permettent :
- En amont de lier les données d’expression génétique avec les cascades de régulation moléculaires préalables et ainsi prédire les Key Hubs (facteur de transcription/enzyme/récepteur) qui en sont à l’origine;
- En aval d’identifier les pathways affectés par ces données d’expression ;
- D’identifier de nouveaux biomarqueurs ainsi que des molécules thérapeutiques candidates à influer sur ces réseaux de régulation »
*Assessing quality and completeness of human transcriptional regulatory pathways on a genome-wide scale Evgeny Shmelkov1,2, Zuojian Tang2, Iannis Aifantis3, Alexander Statnikov2,4*
